El temario clínico del Programa de Magíster incluye 72 sesiones de clases, de 3½ horas cronológicas cada una (un total de 252 horas). Las clases serán desarrolladas por los profesionales estables del equipo ICPSI y por los diversos profesores invitados.   

Durante el Programa de Magíster se desarrollarán  Talleres Clínicos Nacionales, los viernes o sábados. Los Talleres serán dirigidos por psicoterapeutas del más alto nivel nacional.

Durante el curso se desarrollarán Talleres Clínicos Internacionales, los sábados, de 9:00 a 13:00 horas. Los Talleres serán dirigidos por psicoterapeutas del más alto nivel internacional.

Cada alumno del Programa de Magíster deberá atender un mínimo de 160 horas de psicoterapia individual en su consulta y/o en los Consultorios ICPSI (CONPER-ICPSI).

Cada alumno del Programa de Magíster participará en actividades de supervisión grupal, con un total de 144 horas.  Cada alumno deberá supervisar un mínimo de cuatro casos clínicos atendidos por él. Sobre la base del trabajo en espejo de visión unilateral, se realizarán supervisiones in vivo, cuando el caso clínico lo requiera y sea aportativo para el paciente.

A través del Programa de Magíster, cada alumno desarrollará un proceso de auto-exploración orientado a incrementar awareness y auto-conocimiento, con el objeto de potenciar su accionar clínico. Este proceso involucra un trabajo grupal de 100 horas de duración y se desarrollará sobre la base de dos modalidades: Dinámicas grupales de auto-conocimiento y Trabajo personal de auto-exploración en un contexto grupal.

Con el objeto de facilitar el acceso al trabajo clínico de los alumnos del Programa de Magíster, ICPSI cuenta con dos Consultorios de atención pública (CONPER-EPSI). En dichos consultorios (ubicados en Marchant Pereira # 444), los alumnos dispondrán gratuitamente de la infraestructura física y humana requerida y de pacientes indicados para Psicoterapia Integrativa. Esta actividad se realizará a un costo mínimo para el paciente (sólo para financiar costos en infraestructura) y sin lucro alguno para ICPSI o para el alumno.

Cada alumno deberá trabajar, en forma individual, en una tesis de Magíster. La tesis consistirá en un estudio teórico/empírico en el marco de la Psicoterapia Integrativa. El trabajo de tesis implica la realización de una investigación clínica que contempla un desarrollo teórico y una aplicación práctica de los contenidos entregados a través del curso. Se estima un trabajo personal de alrededor de 200 horas bajo la supervisión de un Director de tesis.