Thomas Ledger

Thomas Ledger
Thomas Ledger
Profesor Asistente
Área(s): BIOINGENIERÍA
FACULTAD DE INGENIERÍA Y CIENCIAS
DOCTOR EN GENÉTICA MOLECULAR Y MICROBIOLOGÍA, PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATÓLICA DE CHILE, CHILE, 2008
E-mail: tledger@uai.cl
Sede: SANTIAGO - PEÑALOLÉN
Edificio: E
Número de oficina: 302

RESUMEN

Formación general como Bioquímico, especializado en el área de investigación, y específicamente en genética molecular de microorganismos. He trabajado principalmente en proyectos de investigación básica, financiados por Fondecyt-Conicyt y la Iniciativa Científica Milenio.  Actualmente participo en el Centro de Innovación y Negocios en Bioingeniería.

Principales Programas y Cursos donde participa/participó
Master en Gestión y Emprendimiento Tecnológico (invitado a curso de especialización tecnológica). Ingeniería-plan común (Química y Biología), Ingeniería especialidad de Bioingeniería (Bioinformática).

Principales Publicaciones
• Ledger, T., Pieper, D., Pérez-Pantoja, D., & B. González (2002). Novel insights into the interplay between xyl genes-encoded peripheral reactions and tfd genes-encoded chlorocatechol pathway for degradation of chlorobenzoates by Ralstonia eutropha JMP134. Microbiology. 148: 3431-3440.
• Pérez.-Pantoja, D., Ledger, T., Pieper, D., & B. González (2003). An efficient turnover of chlorocatechols is essential for growth of Ralstonia eutropha JMP134 on 3-chlorobenzoate. J. Bacteriol. 185: 1534-1542.
• Trefault, N., De la Iglesia, R., Molina, A.M., Manzano, M., Ledger, T., Pérez-Pantoja, D., Sánchez, M. A., Stuardo, M., and B. González (2004). Genetic organization of the catabolic plasmid pJP4 from Ralstonia eutropha JMP134 (pJP4) reveals mechanisms of adaptation to chloroaromatic pollutants and evolution of specialized chloroaromatic degradation pathways. Environ Microbiol. 6: 655-668.
• Ledger, T., Pieper, D. H., & B. González (2006). Chlorophenol hydroxylases encoded by plasmid pJP4 differentially contribute to chlorophenoxyacetic acid degradation. Appl Environ Microbiol. 72: 2783-2792.
• Ledger, T., Aceituno, F., & B. González (2009). 3-Chlorobenzoate is taken up by a chromosomally encoded transport system in Cupriavidus necator JMP134. Microbiology 155: 2757-2765.
• Lykidis, A., Pérez-Pantoja, D., Ledger, T., Mavromatis, K., Anderson, I.J., Ivanova, N.N., Hooper, S.D., Lapidus, A., Lucas, S., González, B. & N.C. Kyrpides (2010). The complete multipartite genome sequence of Cupriavidus necator JMP134, a versatile pollutant degrader. PLoS One 5(3):e9729.

Principales Proyectos
• Proyecto FONDECYT 8990004 de Líneas Complementarias (Tesista de Pregrado) “Expresión de genes microbianos involucrados en el catabolismo de compuestos aromáticos, lignina, y hemicelulosa, a nivel de laboratorio y en el ambiente” (1999-2000).
• Proyecto de colaboración Fundación Andes/CONICYT (Colaborador) “Mejoramiento de las capacidades catabólicas hacia análogos clorados en microorganismos que degradan compuestos aromáticos, mediante transferencia de genes que codifican para enzimas de la degradación de clorocatecoles”. En colaboración con Dietmar H. Pieper. German Research Centre for Biotechnology. Braunschweig. Alemania (1999-2003).
• Proyecto FONDECYT 7030039 Concurso Incentivo a La Cooperación Internacional (Colaborador) “Interacción entre funciones plasmidiales (pJP4) y cromosomales en Ralstonia eutropha JMP134 en la evolución de vías catabólicas para la degradación bacteriana de contaminantes cloroaromáticos” (2003-2004).
• Proyecto FONDECYT 1030493 (Colaborador) “Interacción entre funciones plasmidiales (pJP4) y cromosomales en Ralstonia eutropha JMP134 en la evolución de vías catabólicas para la degradación bacteriana de contaminantes cloroaromáticos” (2003-2006).
• Proyecto FONDECYT 1070343 (Investigador Postdoctoral) “Análisis de la expresión génica en el catabolismo de compuestos aromáticos y cloroaromáticos en el modelo bacteriano Cupriavidus necator, en cultivos líquidos y en microcosmos de suelos / planta” (2007-2011).
• Núcleo Milenio en Genómica Funcional de Plantas (PFG) P06/009-F (Investigador Asociado). (2008-2014). Actualmente en ejecución.
• Proyecto CONICYT/BMBF (Investigador Postdoctoral) “Contribución de los plasmidios IncP-1 a la diversidad y adaptabilidad bacteriana”. En colaboración con la Dra. Kornelia Smalla, Instituto Julius Kuhn para la Investigación en Plantas, Braunschweig, Alemania (2008-2010).
• Proyecto de Postdoctorado FONDECYT 3090051 (Investigador Principal) “Effect of Burkholderia phytofirmans PsJN colonization on plant growth and resistance to abiotic stress” (2008-2010).
• Proyecto de Inserción en la Academia (Investigador Inserto) “Fortalecimiento de la Investigación y la Docencia en Ciencias Biológicas Mediante la Inserción de Investigadores Postdoctorales en Áreas Relevantes de la Bioingeniería” (2010-2013). Actualmente en ejecución.


Artículos
2016 Volatile-mediated effects predominate in paraburkholderia phytofirmans growth promotion and salt stress tolerance of Arabidopsis thaliana., Frontiers in Microbiology, 17, artículo 2016.01838
2015 Burkholderia phytofirmans PsJN induces long-term metabolic and transcriptional changes involved in Arabidopsis thaliana salt tolerance. , Frontiers in Plant Science, 6,
2013 Quorum sensing and 3-indole acetic acid degradation play a role in colonization and plant growth promotion of Arabidopsis thaliana by Burkholderia phytofirmans PsJN, Molecular Plant Microbe Interactions, 26, 546-553
2012 Simultaneous assessment of the effects of a herbicide on the triad: rhizobacterial community, a herbicide degrading soil bacterium and their plant host, Plant and Soil, ,
2012 Aromatic compounds degradation plays a role in colonization of Arabidopsis thaliana and Acacia caven by Cupriavidus pinatubonensis JMP134., Antonie van Leeuwenhoek Journal of Microbiology, 101, 713-723
2012 IncP-1? Plasmids are Important Vectors of Antibiotic Resistance Genes in Agricultural Systems: Diversification Driven by Class 1 Integron Gene Cassettes., Frontiers in Microbiology, 3,
2010 The complete multipartite genome sequence of Cupriavidus necator JMP134, a versatile pollutant degrader, PLoS One, 5, e9729
2009 3-Chlorobenzoate is taken up by a chromosomally encoded transport system in Cupriavidus necator JMP134, Microbiology, 155, 2757-2765
2006 Chlorophenol hydroxylases encoded by plasmid pJP4 differentially contribute to chlorophenoxyacetic acid degradation, Applied Environmental Microbiology, 72, 2783-2792
2004 Genetic organization of the catabolic plasmid pJP4 from Ralstonia eutropha JMP134 (pJP4) reveals mechanisms of adaptation to chloroaromatic pollutants and evolution of specialized chloroaromatic degradation pathways, Environmental Microbiology, 6, 655-668
2003 An efficient turnover of chlorocatechols is essential for growth of Ralstonia eutropha JMP134 on 3-chlorobenzoate, Journal of Bacteriology, 185, 1534-1542
2002 Novel insights into the interplay between xyl genes-encoded peripheral reactions and tfd genes-encoded chlorocatechol pathway for degradation of chlorobenzoates by Ralstonia eutropha JMP134, Microbiology, 148, 3431-3440

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